L’Archivio Istituzionale è stato istituito nel 1992 e attualmente è ospitato nell’ufficio di New York. Dal 1965, AAR ha collaborato con l’Archive of American Art dell’istituto Smithsonian, completando quattro depositi di materiali, con articoli che vanno dal 1855 al 2012.
La collezione fotografica dell'Archivio Istituzionale dell'AAR è conservata presso l'Archivio fotografico di Roma e documenta le attività dell'Accademia quale organizzazione culturale internazionale dedicata alle arti e alle discipline umanistiche; comprende la documentazione relativa al lavoro dei borsisti, alla vita dell'Accademia, agli edifici, agli eventi e alle mostre.
